日本放射線技術学会雑誌 Vol 76 No11 Nov 2020 「AI による放射線技術の発展」特集号誌上講座が発刊されました.
この特集号に「Pydicomを使ってDICOM画像を操る」と題してPydicomの解説とサンプルプログラムを投稿しました.
サンプルプログや補足などを以下に記述します.
1.Pydicomとは
Pydicomを簡単に紹介しました.
2.Pydicomプログラミングの準備
2.1.前提条件
- 筆者はAnacondaでPython環境をVersion3.7の環境を構築しました.
- Anacondaにはnumpy, matplotlib, pyQt5は含まれているので改めてインストールの必要はありません.
2.2. DICOM画像データセット
JSRTの標準デジタル画像データベース(DICOM版)の胸部CR画像をダウンロードして解凍します.
2.3.Pydicomのインストール
Pydicomのドキュメント(pydicom documentation,https://pydicom.github.io/pydicom/stable/)も是非参照してください.有用な情報がたくさん得られます.
3.Pydicomを使ってDICOM画像を操る
記事内で紹介したサンプルプログラムをダウンロードして解凍してください.
内容は以下の通りです.
3.1.DICOM画像を表示する
3.2.DICOM画像をPNGに変換する
3.3.DICOM画像の匿名化
3.4.DICOMタグ情報取得の関数化
3.5.セグメンテーションツールを作成する
AI研究のために自施設のDICOM画像を有効に利用できることを願っています.
質問や要望などありましたら uesugi@do-johodai.ac.jp までメールをください.
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